靶向代谢组学_武汉生物万象城AWC(中国)有限公司 -建设武汉国家级人类遗传资源库

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靶向代谢组学

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　　靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照，对指定列表的代谢产物，特别针对一种或几种途径的代谢产物进行有针对性地、特异性地检测与分析。

　　靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。虽然这类分析比代谢谱分析更为常规，但必须面对非常大量(成千上万)的样品。

　　靶向代谢组学可以应用于：

　　(1)验证由发现代谢组学实验提出的假说;

　　(2)进行基于假说的探索性实验(通常根据最新的解释)，针对特定代谢物，研究代谢模型。

　　基本研究流程

　　靶向代谢组学研究流程主要可分为样品收集、标准曲线建立、代谢物提取和分离、上机检测和数据分析等。

　　样本类型

　　血清 • 血浆 • 尿样 • 脑脊液 • 唾液 • 粪便 •微生物 • 细胞 • 植物 • 组织 • 其它

　　服务周期

　　靶向代谢组学服务和周期见下表：

**靶向代谢组学服务和周期**
平台	仪器型号	代谢物	化合物数目	检测周期	检测价格
GC-MS/MS	Aglient 7890A-5975C或8890-7010B	短链脂肪酸	11种短链脂肪酸	约15个工作日	请询价
GC-MS/MS	Aglient 7890A-5975C或8890-7010B	游离脂肪酸	37种游离脂肪酸	约15个工作日	请询价
UHPLC-QqQ MS	SCIEX QTRAP 4500或Triple Quad 4500	维生素	12种水溶性	约20个工作日	请询价
		氨基酸	32种氨基酸
		神经递质	27种神经递质
		植物激素	10种植物激素
		胆汁酸	48种胆汁酸
		辅酶	18种辅酶
		抗生素	105种抗生素

**11种短链脂肪酸绝对定性定量分析**
序号	中文名称	英文名称	分子式	CAS号	相对分子质量
1	乙酸	acetic acid	C₂H₄O₂	64-19-7	60.05
2	丙酸	propionic acid	C₃H₆O2	79-09-4	74.08
3	异丁酸	isobutyric acid	C₄H₈O₂	79-31-2	88.11
4	丁酸	n-butyric acid	C₄H₈O₂	107-92-6	88.11
5	异戊酸	isovaleric acid	C₅H₁₀O₂	503-74-2	102.13
6	戊酸	n-valeric acid	C₅H₁₀O₂	109-52-4	102.13
7	4-甲基戊酸	4-methylvaleric acid	C₆H₁₂O₂	646-07-1	116.16
8	正己酸	hexanoic acid	C₆H₁₂O₂	142-62-1	116.15
9	2-甲基己酸	2-methylhexanoic acid	C₇H₁₄O₂	4536-23-6	130.18
10	正庚酸	n-heptylic acid	C₇H₁₄O₂	111-14-8	130.18
11	正辛酸	n-octanoic acid	C₈H₁₆O₂	124-07-2	144.21

**37种游离脂肪酸绝对定性定量分析**
编号	中文名称	英文名称	简写
1	丁酸	butyric acid	C4:0
2	己酸	caproic acid	C6:0
3	辛酸	caprylic acid	C8:0
4	癸酸	capric acid	C10:0
5	十一烷酸	undecanoic acid	C11:0
6	月桂酸	lauric acid	C12:0
7	十三烷酸	tridecanoic acid	C13:0
8	十四酸	myristic acid	C14:0
9	十四碳烯酸	myristoleic acid	C14:1n5
10	十五烷酸	pentadecanoic acid	C15:0
11	顺-10-十五碳烯酸	cis-10-pentadecenoic acid	C15:1n5
12	棕榈酸	palmitic acid	C16:0
13	棕榈油酸	palmitoleic acid	C16:1n7
14	十七烷酸	heptadecanoic acid	C17:0
15	顺-10-十七烯酸	cis-10-heptadecenoic acid	C17:1n7
16	硬脂酸	stearic acid	C18:0
17	反油酸	elaidic acid	C18:1n9t
18	油酸	oleic acid	C18:1n9c
19	反亚油酸	linolelaidic acid	C18:2n6t
20	亚油酸	linoleic acid	C18:2n6c
21	γ-亚麻酸	r-linolenic acid	C18:3n6
22	α-亚麻酸	α-linolenic acid	C18:3n3
23	花生酸	arachidic acid	C20:0
24	顺-11-二十碳烯酸	cis-11-eicosenoic acid	C20:1
25	顺-11,14-二十碳二烯酸	cis-11,14-eicosadienoic acid	C20:2
26	顺-8,11,14-二十碳三烯酸	cis-8,11,14-eicosatrienoic acid	C20:3n6
27	花生四烯酸	arachildonic acid	C20:4n6
28	二十一烷酸	heneicosanoic acid	C21:0
29	顺-11,14,17-二十碳三烯酸	cis-11,14,17-eicosatrienoic acid	C20:3n3
30	顺-5,8,11,14,17-二十碳三烯酸	cis-5,8,11,14,17-eicosatrienoic acid	C20:5n3
31	山萮酸	behenic acid	C22:0
32	芥酸	erucic acid	C22:1n9
33	顺-13,16-二十二碳二烯酸	cis-13,16-docosadienoic acid	C22:2
34	三十烷酸	tricosanoic acid	C23:0
35	顺-4,7,10,13,16,19-二十二碳六烯酸	cis-4,7,10,13,16,19-docosahexaenoic acid	C22:6n3
36	二十四碳酸	lignceric acid	C24:0
37	神经酸	nervonic acid	C24:1n9

**12种水溶性维生素绝对定性定量分析**
编号	物质名称	英文名称	分子量
1	VB1硫胺素	thiamine	264.35
2	VB2核黄素	Riboflavin	376.36
3	VB3烟酰胺	Nicotinamide	122.12
4	VB5泛酸	(R)-pantothenicacid	219.24
5	VB6吡哆胺	pyridoxamine	168.19
6	VB6吡哆醇	Pyridoxine	169.18
7	VB6吡哆醛	pyridoxal	167.16
8	VB7生物素	Biotin	244.31
9	VB9叶酸	folic acid	441.40
10	VB12钴胺素碎片	Vitamin B12	1355.37
11	对氨基苯甲酸	p-aminobenzoic acid	137.14
12	硫辛酸	thioctic acid	206.33

**32种氨基酸绝对定性定量分析**
编号	中文名称	英文名称	缩写
1	丙氨酸	alanine	ALA
2	肌氨酸	sarcosine	SAR
3	甘氨酸	glycine	GLY
4	α-氨基丁酸	α-aminobutyric acid	ABA
5	缬氨酸	valine	VAL
6	β-氨基异丁酸	β-aminobutyric acid	β-AIB
7	亮氨酸	leucine	LEU
8	别异亮氨酸	allo-isoleucine	aILE
9	异亮氨酸	isoleucine	ILE
10	苏氨酸	threonine	THR
11	丝氨酸	serine	SER
12	脯氨酸	proline	PRO
13	天冬酰胺	asparagine	ASN
14	硫代脯氨酸	thioproline	TPR
15	天冬氨酸	aspartic acid	ASP
16	蛋氨酸	methionine	MET
17	羟基脯氨酸	4-hydroxyproline	4-HYP
18	谷氨酸	glutamic acid	GLU
19	苯丙氨酸	phenylalanine	PHE
20	α-氨基己二酸	ɑ-aminoadipic acid	AAA
21	α-氨基庚二酸	ɑ-aminopimelic acid	APA
22	谷氨酰胺	glutamine	GLN
23	鸟氨酸	ornithine	ORN
24	甘氨酰-脯氨酸（二肽）	glycyl-proline	GPR
25	赖氨酸	lysine	LYS
26	组氨酸	histidine	HIS
27	羟基赖氨酸	hydroxylysine	HLY
28	酪氨酸	trrosinre	TYR
29	脯氨酸-羟基脯氨酸（二肽）	proline-hydroxyproline	PHP
30	色氨酸	tryptophan	TRP
31	胱硫醚	cystathionine	CTH
32	胱氨酸	cystine	C-C

**27种神经递质绝对定性定量分析**
编号	中文名字	英文名字	缩写	分类	CAS号
1	色胺	Tryptamine	-	单胺类吲哚类	61-54-1
2	5-羟色胺	Serotonin hydrochloride	5-HT	单胺类吲哚类	153-98-0
3	5-羟吲哚乙酸	5-hydroxyindoleacetic acid	5HIAA	单胺类吲哚类	54-16-0
4	犬尿喹啉酸	Kynurenic acid	KYNA	单胺类吲哚类	492-27-3
5	褪黑激素	Melatonin	-	单胺吲哚类	73-31-4
6	5-羟基色氨酸	5-Hydroxy-Tryptophan	5-HTP	单胺吲哚类	4350-09-8
7	肾上腺素	Epinephrine	EP	单胺类儿茶酚胺类	329-63-5
8	去甲肾上腺素	noradrenaline bitartrate	NE	单胺类儿茶酚胺类	108341-18-0
9	多巴胺	Dopamine	DA	单胺类儿茶酚胺类	62-31-7
10	高香草酸	homovanillic acid	NMN	单胺类儿茶酚胺类	306-08-1
11	香草扁桃酸	4-hydroxy-S-methoxymandelic acid	VM-A	单胺类儿茶酚胺类	55-10-7
12	去甲变肾上腺素	rac Normetanephrine	-	单胺类儿茶酚胺类	1011-74-1
13	3-甲氧酪胺	3-Methoxy-p-tyramine	-	单胺类儿茶酚胺类	1477-68-5
14	酪胺	Tyramine	-	单胺类儿茶酚胺类	51-67-2
15	二羟苯乙酸	3,4-Dihydroxyphenylacetic acid	DOPAC	单胺类儿茶酚胺类	102-32-9
16	胆碱	Choline Chloride	-	单胺类胆碱类	67-48-1
17	乙酰胆碱	Acetylcholine	Ach	单胺类胆碱类	60-31-1
18	组胺	Histamine	-	氨基酸类	51-45-6
19	犬尿氨酸	Kynurenine	-	氨基酸类	2922-83-0
20	谷氨酰胺	Glutamine	GLN	氨基酸类	56-85-9
21	谷氨酸	Glutamic Acid	GLU	氨基酸类	56-86-0
22	4-氨基丁酸	4-Aminobutyric Acid	GABA	氨基酸类	56-12-2
23	酪氨酸	Tyrosine	TYR	氨基酸类	60-18-4
24	精氨酸	Arginine	Arg	氨基酸类	74-79-3
25	组氨酸	Histidine	HIS	氨基酸类	71-00-1
26	苯基丙氨酸	Phenylalanine	PHE	氨基酸类	63-91-2
27	色氨酸	Tryptophan	TRP	氨基酸类	73-22-3

**10种植物激素绝对定性定量分析**
编号	中文名	英文名	简称
1	反-玉米素	Trans-Zeatin	t-ZT
2	赤霉素	Gibberellin A3	GA3
3	吲哚乙酸	3-Indoleacetic acid	IAA
4	水杨酸	Salicylic acid	SA
5	茉莉酸	Jasmonic acid	JA
6	脱落酸	Abscisic acid	ABA
7	吲哚丁酸	3-Indolebutyric acid	IBA
8	6-苄氨基嘌呤	6-Benzylaminopurine	6-BA
9	茉莉酸甲酯	Methyl jasmonate	JA-ME
10	激动素	6-Furfurylaminopurine	6-KT

**48种胆汁酸绝对定性定量分析**
编号	简称	常用名	编号	简称	常用名
1	DLCA	Dehydrolithocholic acid	25	3β-CA	3β-Cholic Acid
2	LCA	Lithocholic acid	26	α-MCA	α-Muricholic acid
3	ILCA	Isolithocholic acid	27	12-DHCA	12-Dehydrocholic acid
4	NDCA	23-Nordeoxycholic acid	28	λ-MCA （HCA)	λ-Muricholic acid
5	6-KLCA	6-Ketolithocholic acid	29	CA	Cholic acid
6	7-KLCA	7-Ketolithocholic acid	30	AlCA	Allocholic acid
7	12-KLCA	12-Ketolithocholic acid	31	GLCA	Glycolithocholic acid
8	ApCA	Apocholic acid	32	GCDCA	Glycochenodeoxycholic acid
9	MoCA	Murocholic acid	33	TLCA	Taurolithocholic acid
10	TCDCA-d5	Taurochenodeoxycholic-d5 acid	34	GHDCA	Glycohyodeoxycholic acid
11	β-HDCA	β-Hyodeoxycholic Acid	35	GDHCA	Glycodehydrocholic acid
12	UDCA	Ursodeoxycholic acid	36	λ-GMCA (GHCA)	Glyco-λ-muricholic acid
13	CDCA	Chenodeoxycholic acid	37	TDCA	Taurodeoxycholic acid
14	DHCA	Dehydrocholic acid	38	GUDCA	Glycoursodeoxycholic acid
15	HDCA	Hyodeoxycholic acid	39	TUDCA	Tauroursodeoxycholic acid
16	IDCA	Isodeoxycholic acid	40	THDCA	Taurohyodeoxycholic acid
17	NCA	23-Norcholic acid	41	TCA	Taurocholic acid
18	DCA	Deoxycholic acid	42	GDCA	Glycodeoxycholic acid
19	DiLCA	Dioxolithocholic acid	43	TDHCA	Taurodehydrocholic acid
20	6,7-DKLCA	6,7-Diketolithocholic acid	44	α-TMCA	Tauro-α-muricholic acid
21	7-KDCA	7-Ketodeoxycholic acid	45	β-TMCA	Tauro-β-muricholic acid
22	β-MCA	β-Muricholic acid	46	λ-TMCA	Tauro-λ-muricholic acid
23	3-DHCA	3-Dehydrocholic acid	47	ω-TMCA	Tauro-ω-muricholic acid
24	UCA	Ursocholic acid	48	GCA	Glycocholic acid

**18种辅酶绝对定性定量分析**
序号	常用名	中文名字
1	NAD+	氧化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
2	NADP+	氧化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
3	NADH	还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸
4	NADPH	还原型酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸
5	ATP	三磷酸腺苷
6	ADP	二磷酸腺苷
7	AMP	一磷酸腺苷
8	Creatinephosphate	磷酸肌酸
9	Creatine	肌酸
10	Creatinine	肌苷
11	2'-deoxyuridine	脱氧尿苷
12	Cytosine	胞嘧啶
13	Adenosine	腺苷
14	Thymine	胸腺嘧啶
15	Cytidine	胞啶
16	Uridine	尿苷
17	Guanosine	鸟苷
18	UMP	尿苷酸

**105种抗生素绝对定性定量分析**
物质类别	物质列表
Sulfonamides （磺胺类：30种）	sulfapyridine, sulfadoxine, sulfathiazole, sulfamethizole, sulfamethazine, sulfadiazine, sulfaquinoxaline, sulfachloro pyridazine, sulfisomidine, sulfadimethoxine, sulfaguanidine, sulfanilamide, sulfacetamide, sulfamerazine, sulfamoxole, succinylsulfathiazole, sulfamethoxazole, sulfamethoxypyridazine, sulfamonomethoxine, sulfisoxazole, sulfanitran, sulfaclozine , sulfameter , trimethoprim, sulfasalazine, N-acetylsulfapyridine, N-acetylsulfadiazine, N-acetylsulfamethazine, N-acetylsulfamethoxazole, N-acetylsulfamerazine
Quinolones （喹诺酮类：20种）	enrofloxacin, ciprofloxacin, danofloxacin, difloxacin, enoxacin, lomefloxacin, norfloxacin, ofloxacin, pefloxacin, sarafloxacin, sparfloxacin, cinoxacin, moxifloxacin, flumequine, pipemidic acid, nalidixic acid, fleroxacin, oxolinic acid, piromidic acid, levofloxacin
Tetracyclines （四环素类：14种）	oxytetracycline, tetracycline, chlortetracycline, minocycline, methacycline, doxycycline, 4-epianhydrotetracycline, Isochlortetracycline, 4-epitetracycline, anhydrotetracycline, 4-epianhydrochlortetracycline, 4-epioxytetracycline, α-apo-oxytetracycline, β-apo-oxytetracycline
Macrolides （大环内酯类：16种）	erythromycin, clarithromycin, clindamycin, roxithromycin, tilmicosin, lincomycin, ormetoprim, oleandomycin, azithromycin, virginiamycin M1, virginiamycin S1, kitasamycin, spiramycin, tylosin, midecamycin, midecamycin
β-lactams （β-内酰胺类：14种）	Cefalexin, cefradine, cefotaxime, ampicillin, amoxicillin, dicloxacillin, cefazolin, cloxacillin, cefaclor, penicillin V, cefapirin, piperacillin, ceftiofur, penicillin G
Chloramphenicols （氯霉素类：3种）	chloramphenicol, thiamphenicol, florfenicol
Polypeptides and other antibiotics （多肽和其他抗生素：8种）	bacitracin A, colistin A, colistin B, furazolidone, monensin, salinomycin, narasin, tiamulin

项目优势

　　a.标准化技术平台：拥有标准化的实验操作规范和先进的技术平台，实验周期短，质量可靠；

　　b.拥有多种先进检测设备：拥有Aglient 7890A/5975C单四级杆气-质联用仪、Aglient 8890-7010B三重四级杆气质联用仪、SCIEX TripleTOF 5600 plus高分辨质谱仪、SCIEX QTRAP 4500和SCIEX Triple Quad 4500三重四级杆质谱系统，以及Agilent 600兆超低温核磁共振波谱仪等代谢组学分析平台；

　　c.专业的数据库：拥有多个商业数据库，同时建立了超过百个标准品数据库，使定性更加准确；

　　d.多重质控保障：分析过程采用严格的方法验证步骤，多重质控保证实验可靠；

　　e.给予个性化服务：拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为合作伙伴给予个性化的生物信息分析服务；

　　f.完善的售后服务：完善的售后服务，从报告解读至文章发表，可全程给予高效高质量的服务；

　　g.开发种类多样：已开发出几大类常见代谢物靶向代谢组学分析，如代谢通路、靶向代谢物、植物代谢物、有机化合物、无机化合物、氧化应激化合物等。

　　文献：Mathé EA, et al., Noninvasive urinary metabolomic profiling identifies diagnostic and prognostic markers in lungcancer. 2014, Cancer Research, 74(12):3259-70 (IF=9.32)

实验材料：

　　前期筛选样本(1005例)：花费十年(1998~2007)收集样本：469例病人(治疗前尿液)+536例健康人

　　后期验证样本(158例)：近期(2008–2010)收集的样本：80例病人(治疗前尿液)+78例健康人

　　组织样品：48例肿瘤组织及其周边非肿瘤组织

　　研究流程：

　　概述：前期非靶筛选+后期靶向MRM验证

　　实验流程：

　　研究结论：

　　前期筛选：前期筛选样品的非靶向代谢组学分析，正离子模式下共检测到1807个信号，负离子检测到1359个。顺利获得对吸烟相关代谢物(Cotinine、Nicotine-N’-oxide和Trans-3’-hydroxycotinine)的检测，发现可以很好的将吸烟人群与非吸烟人群区分开，验证了分析方法的可行性。

　　数据分析：

　　a.诊断与分型研究：应用统计学分析方法，排除人种和性别的干扰后，作者鉴定到了四个差异代谢物：NANA、Cortisol sulfate、Creatine riboside 和 561+(未鉴定物质)。ROC分析发现四个差异代谢物在所有人群中AUC值在0.63~0.76之间，在I-II期肺癌人群中在0.59~0.70之间。其中用Creatine riboside或者全部四种代谢物预测更加准确(P<0.00001)。

　　Overlap between signals that are predictive of lung cancer status in the training set based on the Random Forests classification.

　　Receiver Operating Characteristic (ROC) analysis of individual metabolites and their combination

　　b.预后研究：在综合考虑了性别、人种、疾病阶段、组织切片、吸烟史、放化疗、外科手术等多方面因素后作者发现高含量的NANA、Cortisol sulfate、Creatine riboside和561+带来不好的预后效果(存活率低)，而且这四种代谢物与存活率的相关性是独立的但却有累加效应;在I-II期肺癌人群中，高含量的Creatine riboside和561+也会降低病人的存活率。

　　Kaplan-Meier survival estimates in the training set are depicted for the top four predictive metabolites

　　c.后期验证：同样使用非靶向代谢组学方法，发现在验证人群(80例病人+78例健康人)中Creatine riboside、NANA和561+在病人尿液中的含量都有显著升高。在排除年龄、性别与人种干扰后选择198例样品(92例病人+106例健康人)进行靶向代谢组学，验证了这四种代谢物与疾病的相关性。此外，为证明这四种代谢物的稳定性，作者样品保存两年后再次重复了实验，证明它们临床应用的价值。

　　Abundance and validation of metabolites that were top contributors in the classification of patients as lung cancer or healthy controls.

　　d.机理研究方面的延伸：作者最后在肿瘤组织中检测上述四种代谢物的含量，发现与邻近组织相比，肿瘤组织中Creatine riboside和NANA的含量明显升高，同时Creatine的含量也有增加。

　　Linking urinary metabolites to lung cancer tissue metabolome.

　　总结：

　　本篇文章是非常经典的代谢组生物标志物研究范例，前期非靶向的筛选加上后期的靶向验证，非常值得借鉴学习。

　　文章最后从体液类样品再次回归组织类样品，叩开了后期机理研究的大门，这种研究思路也非常值得临床研究借鉴。

　　1.代谢组学送样量参考标准

检测策略/方法	血样	尿液	脑脊液	粪便	微生物	细胞	组织	植物
非靶向代谢组	500ul	1ml	200ul	2g	250mg	10⁷个	250mg	250mg
靶向代谢组	500ul	1ml	200ul	2g	250mg	10⁷个	250mg	250mg
NMR代谢组	500ul	1ml	500ul	2g	500mg	10⁷个	500mg	500mg

　　2.代谢组学送样生物学重复性要求

　　代谢组的差异变化是基因组变化放大效应的呈现，不同个体中代谢物的波动性也就较大。另一方面，代谢组学的差异分析一般是基于PCA和PLS-DA等多元统计分析方法进行的，只有较大的样本量抽提出的主成分才具有群体代表性。因此，相对于基因组学等技术方法，代谢组学要求样品的生物学重复要更多。

　　a.临床标本大于30例；

　　b.模式动物样品大于10例；

　　c.植物微生物样品每组大于8例；

　　d.细胞样品大于6例。

　　3.代谢组学送样品收集标准

样本类型		收集标准
血液	血清	静脉抽血3~4mL，置于采血管内（不放置任何抗凝剂及促凝剂）；4℃静置30~60min（不超过2h），待血液凝固；3500rpm、4℃，离心10 分钟，待血细胞完全沉降后，吸取上层血清，保存于-80℃保存。
	血浆	采集血液样本，置于含有适量抗凝剂（慎用Citrate 抗凝剂；NMR检测推荐用Heprin抗凝剂；质谱检测推荐用EDTA抗凝剂（K2、K3、Na、绝对不有Li）的采集管内；反复颠倒采血管，使抗凝剂与血液充分混匀；以2000-3000rpm离心10 min（血样采集后室温放置1h之内进行离心；血样采集后冰上放置可以在4 h内进行处理），上清液即为血浆；保存于-80℃冰箱。
尿液		收集尿液（严禁加入叠氮钠等抑菌剂以免对质谱测试产生干扰）置离心管（推荐用PP材料）中，10000rpm、4℃，离心10 分钟，取上清液，置-80℃保存。建议在送样代谢组学检测同时进行尿肌酐的检测。
其它体液样本		收集过程尽量不添加其它试剂，收集至离心管后液氮速冻，置-80℃保存。
细胞	贴壁细胞（每皿细胞量不少于1.0E7）	处理前将每皿细胞计数，弃去培养皿中的培养液，每皿加入10ml 去离子水洗去培养基，震摇2s（不要过于激烈，防止细胞破裂），加入15ml 的液氮淬灭（2mins），加入1.5ml，-80℃预冰的甲醇，用刮刀刮。
	不贴壁的细胞	将混悬液完整转移至1.5ml 的离心管中，4 °C，13000rpm 离心10min，取固定体积上清液（每皿取等量体积，尽量多取，比如0.8mL），置1.5mL 离心管中，置-80℃保存。同时，将细胞碎片称重予以记录。
	细胞培养液（2mL/例）	将每皿待测细胞培养液吸取固定体积，置2mL 离心管， 10000rpm、4℃，离心10 分钟，取上清液，-80℃保存。
粪便		从粪便的不同部位挑取3个点，称重，置离心管中（严禁加入叠氮钠等抑菌剂以免对质谱测试产生干扰），-80℃保存。
组织	动物组织样本	全程冰上操作，尽量减少操作时间。去除血液（心、肝、肾、肺可行心脏灌流，其他组织可用预冷PBS 淋洗数次）干扰，置液氮速冻，-80℃ 保存。
	人组织样本及肿瘤样本	尽量减少操作时间。去除血液（预冷PBS 淋洗数次）干扰，置液氮速冻，-80℃保存。
微生物及菌类样本		收集10⁷个/例细菌或500mg/例菌丝于离心管内，若菌丝无法判断具体量，可以黄豆粒大小为标准，迅速液氮速冻，-80℃保存。
植物样本		建议粉碎后称重，液氮速冻，-80℃保存。也可寄送未粉碎样品。

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