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转录组测序(RNA-seq)
转录组测序技术作为精准医学与药物研发领域的重要支撑手段,其研究对象为特定细胞、组织、器官在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点,顺利获得新一代高通量测序技术,能够全面、高效捕获某一物种特定细胞、组织或器官在特定条件下的全量转录本序列信息。在药物研发过程中,转录组测序广泛应用于新药靶点筛选、药物作用机制解析、药物响应评估等多个关键环节。例如,在药物早期研发阶段,可顺利获得差异表达分析识别疾病相关的基因及关键调控通路,辅助确定干预靶点及分子机制;在临床前研究中,可结合动物模型或体外细胞模型评估候选药物的毒性反应和生物学效应;在临床研究阶段,转录组数据可用于疾病亚型分型、生物标志物发现和个性化用药策略的制定。随着人工智能和多组学整合分析的开展,转录组测序正在成为贯穿药物全生命周期的核心技术工具,显著提升新药研发效率与精准治疗水平。
miRNA-seq
UMI miRNA测序,文库构建时引入特异性分子标签(UMI),结合高通量测序实现精准定量,研究某物种某组织在特定时空状态下18-30 nt的miRNA片段序列信息,顺利获得与数据库比对, 可实现miRNA序列的鉴定、靶基因分析和功能分析。在疾病研究方面,可研究疾病发生调控机制、寻找生物标记、靶向药物研究等。
微量细胞转录组测序(SMART-seq2)(RNA)
微量细胞转录组测序Smart-seq2技术是一种基于单细胞或极少量RNA样本的高精度转录组测序方法,其核心原理是顺利获得模板转换(template switching)技术实现全长cDNA的高效扩增。该技术顺利获得末端转移酶在反转录产物末端添加寡核苷酸序列,结合PCR扩增,突破了传统方法对样本量的限制,能够从单个细胞或pg级RNA中获取覆盖全转录本的基因表达信息,尤其适用于低丰度RNA的检测。Smart-seq2技术具有高灵敏度和高准确性,在单细胞基因表达分析、肿瘤异质性研究、胚胎发育追踪等领域具有广泛应用价值,为解析复杂生物系统的分子机制给予了重要工具。
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